桃園大潭藻礁面臨興建第三天然氣接收站的爭議，在破壞7000多年藻礁生態，以及毀損保育類柴山多杯孔珊瑚之下，環評時民間環委多數退出，但是官方環委依舊強勢通過。

藻礁守護團體召開100多場記者會與守護活動，透過各種方式保護藻礁，現今計畫透過公投行動，呼籲更多人加入搶救。

知本濕地位於知本溪北側的廣大濕地，成為台灣東部的重要濕地環境，也是候鳥的東部重要棲息地，更是部落的傳統領域。

但是光電開發，計畫在濕地上舖設光電板，引發破壞生態爭議，同時引發開發與保護的部落意見分裂，形成重大爭議。

彰濱海岸有廣大的潮間帶濕地，長期作為工業區開發土地，過去國光石化開發，引爆激烈環境運動，最後終止。

但是政府始終沒有為彰濱濕地正名，劃設保護區，就始終陷於開發的憂慮。現今光電場計畫在濁水溪河口北岸開發，形成新的濕地危機。

高雄茄萣濕地是過去的鹽灘地，在廢棄之後，形成自然的濕地，成為候鳥度冬的重要棲地。

但是長期以來面臨開發，濕地不斷被切割，並且規劃新的道路工程，讓棲地日益破碎化，影響候鳥的棲息環境。

嘉義布袋廢鹽田與滯洪池，長期以來都是候鳥的重要棲地，成為台灣南部重要的海岸濕地環境。

但是光電開發，不斷佔據濕地面積，讓一些雁鴨科水鳥減少，卻引來鷺科鳥類棲息，並且大量排糞在光電板上，成為荒謬的景象。

宜蘭52甲是典型的農田濕地，地勢相當低窪，平日部分稻田，部分草澤，大雨時就積水成汪洋。

但是因為宜蘭農地建農舍，土地利益高漲，52甲濕地也陷於難以劃設濕地，不斷有著開發的危機。